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S'il y a un mélange de différentes structures du même composé à cette température, environ 99, 99% des molécules se transforment en conformation de chaise. Lorsque l'on considère la symétrie de cette molécule, nous pouvons la nommer D3d. Ici, tous les centres carbone sont équivalents. Il y a six atomes d'hydrogène qui se produisent en position axiale. Les six autres atomes d'hydrogène sont situés presque perpendiculairement à l'axe de symétrie, qui est la position équatoriale. Si nous considérons les atomes de carbone, chacun d'eux contient deux atomes d'hydrogène: un atome d'hydrogène «vers le haut» et l'autre «vers le bas». Il y a peu de contrainte de torsion car les liaisons C-H sont en conformation décalée. Qu'est-ce que la conformation du bateau? [Biochimie] chaise ou bateau !!. La conformation du bateau est une structure moins stable du cyclohexane car cette structure a une énergie élevée. Il y a une contrainte stérique considérable dans cette structure en raison de l'interaction entre deux hydrogènes de mât, et il y a aussi une contrainte de torsion considérable.
Sur la forme chaise A, le groupe méthyle est en position axiale alors que sur la forme chaise B (chaise inverse de A) le groupe méthyle est en position équatoriale. C'est donc une première notion à retenir. Tous les substituants en position axiale ( Ax) se retrouvent en position équatoriale ( Eq) lorsqu'on passe à la chaise inverse (et réciproquement). Le plus dur dans ces représentations de cyclohexanes, est de mettre correctement les liaisons axiale et équatoriale. Configurations absolue R,S et Z,E pour les doubles liaisons. Heureusement, pour y arriver il existe quelques moyens simples. La première règle à retenir est que sur un carbone hybridé sp 3, toutes les liaisons partant d'un même atome de carbone sont distantes entre elle d'un angle de 109°27', ce qui, comme nous allons le voir, permet de placer les liaisons axiales et équatoriales que dans une et une seule position. Dans un premier temps, pour positionner les liaisons axiales, il est nécessaire de regarder l'atome de carbone le plus à droite de ce cycle (ou conformation). Si cet atome est dirigé vers le haut, alors la liaison axiale est dirigée vers le haut.
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