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Ces fonctions lapply, sapply, tapply et lapply permettent d' appliquer une fonction ( mean, par exemple, pour calculer une moyenne) sur des données, de façon itérative. Autrement dit, elles font la même chose qu'une boucle for(), tout en ayant une syntaxe concise, puisque ça se passe en une ligne de commande, et en étant plus rapide. Néanmoins, de mon côté, j'ai toujours eu des difficultés à les employer parce que je ne me souviens jamais laquelle utiliser selon: la structure de mes données d'entrées (data frame, vecteur, liste), ce que je veux faire (appliquer une fonction par sous-groupe de données, appliquer une fonction sur les marges (sur chaque ligne ou chaque colonne) d'un data frame), ce que je souhaite obtenir en sortie (un vecteur, une liste). Savoir utiliser ces fonctions peut cependant s'avérer très utile. Alors, j'ai fini par me faire un petit mémo, que je vous partage ici. Sapply - Groupe des utilisateurs du logiciel R. Elle réalise une boucle sur une structure de type liste, en appliquant une fonction sur chaque élément de cette liste.
La famille des fonctions apply est intégrée dans le package base déjà chargé en mémoire dans RStudio. Ces fonctions évitent d'avoir recours aux boucles. Dans ce TP, nous aborderons uniquement les fonctions apply, lapply et tapply. Mais, il en existe d'autres telles que sapply, mapply, vapply, etc. Fonction apply La fonction apply est la fonction de base des fonctions de cette famille. Lapply sous r us. Elle est utile pour appliquer une fonction sur chaque colonne d'une matrice. L'argument MARGIN permet de préciser si on veut appliquer la fonction mean pour chaque ligne ou chaque colonne. Ici l'objet X convertit le data frame en matrice, c'est pourquoi la fonction apply renvoie que des vecteurs de type character. apply ( X = iris, MARGIN = 2, FUN = class) ## Species ## "character" "character" "character" "character" "character" apply ( X = iris[, 1: 4], MARGIN = 2, FUN = mean) ## ## 5. 843333 3. 057333 3. 758000 1. 199333 Fonction lapply La fonction lapply se construit de la même façon que la fonction apply à l'exception que le résultat renvoyé est une liste La fonction lapply prend en entrée une liste, un vecteur ou un data frame / matrice contrairement à la fonction apply.
936 ## iris$Species: virginica ## [1] 6. 588 On peut aussi employer cette syntaxe: with(iris, tapply(, Species, mean)) ## 5. 588 Et comme précédemment, si la fonction employée nécessite des arguments supplémentaires, on les ajoute après la virgule: res <- with(iris, tapply(, Species, quantile, probs=c(0. 75))) ## $setosa ## 4. 8 5. 2 ## $versicolor ## 5. 6 6. Lapply sous r mon compte. 3 ## $virginica ## 6. 225 6. 900 ## [1] "array" La fonction apply permet d'appliquer une fonction sur toutes les lignes ou toutes les colonnes d'un data frame (ou une matrice). Si on souhaite appliquer la fonction sur les lignes, on va spécifier l'argument MARGIN=1 (en pratique, on utilise que le 1 en second argument de la fonction). De la même manière, si on souhaite appliquer la fonction sur les colonnes, on va spécifier l'argument MARGIN=2 (là encore, en pratique, on utilise que le 2 en second argument de la fonction) Par exemple ici, si on souhaite faire la moyenne des 4 premières variables du jeu de données iris, sur les 10 premières lignes: res <- apply(iris[1:10, 1:4], 1, mean, ) ## 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ## 2.
Nous créons une fonction nommée avg pour calculer la moyenne du minimum et du maximum du vecteur. avg <- function(x) { ( min(x) + max(x)) / 2}fcars <- sapply(dt, avg)fcars Sortie ## speed dist## 14. 5 61. 0 La fonction sapply() est plus efficace que lapply() dans la sortie retournée parce que sapply() stocke les valeurs directement dans un vecteur. Lapply sous r studio. Dans l'exemple suivant, nous verrons que ce n'est pas toujours le cas. Nous pouvons résumer la différence entre apply(), sapply() et `lapply() dans le tableau suivant: lapply Fonction Arguments Objectif. Entrée apply apply(x, MARGIN, FUN) Appliquer une fonction aux lignes ou aux colonnes ou aux deux Cadre de données ou matrice vecteur, liste, tableau lapply(X, FUN) Appliquer une fonction à tous les éléments de l'entrée Liste, vecteur ou cadre de données liste sappy sappy(X FUN) vecteur ou matrice Trancher un vecteur Nous pouvons utiliser lapply() ou sapply() de manière interchangeable pour trancher un cadre de données. Nous créons une fonction, below_average(), qui prend un vecteur de valeurs numériques et renvoie un vecteur qui ne contient que les valeurs strictement supérieures à la moyenne.
La fonction apply() est principalement utilisée pour éviter les utilisations explicites des constructions de boucle. Elle est la plus basique de toutes les collections peut être utilisée sur une matrice. Cette fonction prend 3 arguments: apply(X, MARGIN, FUN)Here:-x: an array or matrix-MARGIN: take a value or range between 1 and 2 to define where to apply the function:-MARGIN=1`: the manipulation is performed on rows-MARGIN=2`: the manipulation is performed on columns-MARGIN=c(1, 2)` the manipulation is performed on rows and columns-FUN: tells which function to apply. Built functions like mean, median, sum, min, max and even user-defined functions can be applied> L'exemple le plus simple est de sommer une matrice sur toutes les colonnes. Mémo sur les fonctions lapply, sapply, tapply, apply - DellaData. Le code apply(m1, 2, sum) va appliquer la fonction sum à la matrice 5×6 et retourner la somme de chaque colonne accessible dans le jeu de données. m1 <- matrix(C<-(1:10), nrow=5, ncol=6)m1a_m1 <- apply(m1, 2, sum)a_m1 Sortie: Best practice: Stockez les valeurs avant de l'imprimer sur la console.